Academic Health System Universitas Indonesia (AHS UI) merupakan suatu sistem jejaring antara seluruh Fakultas yang tergabung dalam Rumpun Ilmu Kesehatan UI (Fakultas Kedokteran, Fakultas Kedokteran Gigi, Fakultas Kesehatan Masyarakat, Fakultas Ilmu Keperawatan, dan Fakultas Farmasi) dengan Rumah Sakit Pendidikan dalam hal tata kelola, peningkatan kapasitas sumber daya manusia, dana, pendidikan, penelitian dan pelayanan kesehatan sebagai upaya mengimplementasikan budaya akademik dan pelayanan yang berjenjang dan berkesinambungan.

Sistem Kesehatan Akademik adalah sebuah konsep yang mengintegrasikan pendidikan kedokteran bergelar, dengan satu atau lebih program pendidikan profesional kesehatan lainnya yang memiliki satu atau lebih rumah sakit pendidikan atau berafiliasi dengan rumah sakit pendidikan, sistem kesehatan, dan organisasi pelayanan kesehatan lainnya.

Perjalanan AHS UI dimulai pada tahun 2014 dimana Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia (FKUI) bersama dengan Rumah Sakit Pendidikan Utama FKUI yaitu Rumah Sakit Umum Pusat Nasional Cipto Mangunkusumo (RSCM) menginisiasi pembentukan AHS UI. Pembentukan ini dikuatkan dengan adanya SK Bersama Kemenkes dan Kemendikbud tentang Sistem Integrasi Pendidikan dan Pelayanan Kesehatan dari UI dengan RS Pendidikan Jejaring Academic Health System (SK Bersama No. HK.02.05/Menkes/404/2014).

Setelah itu, pada tahun 2017, Rektor Universitas Indonesia Periode 2014-2019, Prof. Dr. Ir. Muhammad Anis, M.Met. membuat Keputusan Rektor UI Tentang Academic Health System (SK Rektor Nomor: 0399/SK/R/UI/2017). Selanjutnya, pada tahun 2018, Kemenristek mengeluarkan SK tentang Penugasan Perguruan Tinggi Untuk Program Percontohan Sistem Kesehatan Akademik (SK Kemenristekdikti RI Nomor 55/M/KPT/2018). Pada 14 Desember 2018, AHS UI melakukan pertemuan dengan Menkes RI Periode 2014-2019, Prof. Dr. dr. Nila Djuwita F. Moeloek, SpM(K).

Pada Juli 2018, FKUI terpilih sebagai Association Academic Health Centre International (AAHCI) Southeast Asia Regional Office. Hal ini juga diikuti oleh pengangkatan resmi Koordinator dan Wakil Koordinator AHS UI melalui SK Rektor Nomor: 560/SK/R/UI/2018. Tahun 2018 merupakan tahun penting dalam perjalanan AHS UI, dimana Perjanjian Kerja Sama antara AHS UI, RS Persahabatan, RS Kanker Dharmais, RS Fatmawati, dan RS Pusat Otak Nasional diresmikan. Selain itu, AHS UI melakukan pertemuan dengan Gubernur DKI Jakarta, Anies Baswedan, PhD, serta Dinas Kesehatan DKI Jakarta untuk membahas rencana kerja sama agar AHS UI dapat membantu pemerintah dalam menyelesaikan permasalahan kesehatan di Jakarta.

Pada akhir tahun, tanggal 19 OKtober 2019, FKUI menjadi tuan rumah kegiatan terbesar AAHCI Regional Asia Tenggara yakni “AAHCI Southeast Asia Regional Meeting”. Kemudian, pada Rabu 5 Februari 2020, AHS UI menyelenggarakan Workshop untuk membahas pembuatan rencana strategi AHS UI periode 2020-2024 dengan Fakultas Rumpun Ilmu Kesehatan UI beserta perwakilan RSCM dan RS jejaring AHS. Selain itu, AHS UI juga berpartisipasi dalam program hibah penelitian tahun 2020 yang diadakan oleh Pemprov DKI Jakarta melalui Dinas Kesehatan dengan melibatkan Fakultas Kedokteran dan Fakultas Kesehatan Masyarakat Universitas Indonesia.